Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms