Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms