Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl3Q8CD19 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms