Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RybpQ8CCI5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms