Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms