Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa5Q8C7G5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms