Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col6a6Q8C6K9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Col6a6Q8C6K9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Col6a6Q8C6K9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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