Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ubqln3Q8C5U9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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