Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska3Q8C263 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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