Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka5Q8C050 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka5Q8C050 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms