Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TnrQ8BYI9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnrQ8BYI9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms