Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd2Q8BY35 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Fgd2Q8BY35 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd2Q8BY35 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms