Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrtm1Q8BXQ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrtm1Q8BXQ3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrtm1Q8BXQ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrtm1Q8BXQ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrtm1Q8BXQ3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrtm1Q8BXQ3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrtm1Q8BXQ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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