Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms