Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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