Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf3Q8BQU3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms