Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c2Q8BL74 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c2Q8BL74 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c2Q8BL74 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c2Q8BL74 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c2Q8BL74 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf3c2Q8BL74 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c2Q8BL74 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms