Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms