Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms