Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms