Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms