Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4cQ811C2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms