Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms