Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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