Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc29Q80VM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc29Q80VM3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc29Q80VM3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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