Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rims3Q80U57 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms