Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdh8Q7TSK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms