Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms