Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms