Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms