Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS73

Rflna, Refilin-A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnaQ7TS73 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnaQ7TS73 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms