Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms