Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms