Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6aQ78XR0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms