Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms