Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme8Q715T0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme8Q715T0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms