Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27Q6ZWU9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms