Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms