Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms