Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinlQ6ZQ12 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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