Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms