Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms