Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rhox8Q6VSS7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms