Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd300aQ6SJQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms