Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms