Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasa4Q6PFQ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasa4Q6PFQ7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms