Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmeff1Q6PFE7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmeff1Q6PFE7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmeff1Q6PFE7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmeff1Q6PFE7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmeff1Q6PFE7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmeff1Q6PFE7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms