Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms