Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trak1Q6PD31 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms