Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb40Q6PCS8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms